ワイヤーカットの電磁波は電子レンジの何倍？

健康被害という面なら電磁波は無視しても問題ないでしょう。
(蓋が開いた電子レンジとか大出力レーダーレベルで熱傷が問題になる程度)

水って電波領域は吸収しやすいですし。
(雨の日の衛星放送とか受信失敗しやすい理由)
溶接の方がやばいです。

騒音・振動や臭いの方が健康に影響すると思います。

イヤホンで音楽聞いてノイズが気にならなければ全く問題なし。
ノイズが聞こえるようだと携帯・スマホの通信エラーが増えてバッテリーの減りが早くなる…かも。

＞ワイヤーカットの電磁波は電子レンジの何倍位でしょうか？

科学的なアプローチで、電磁波の影響を考えてみようとお考えであれば、
ワイヤー放電加工機の発生する電磁波の周波数帯を特定したほうがいいと
思います。

電子レンジは、マグネトロンという真空管で発生させる2.45GHzの電磁波を
応用する電気機器です。電子レンジから漏れる電磁波は、2.45GHzの周波数
の単一スペクトルです。レンジの庫内は、食品を加熱するために必要な
強力な電磁界が発生していますが、庫外への漏れは一般消費者が使用する
に際して十分安全を保てるように、限度値が定めれれています。漏れを
限度値以下に抑えるようにシールド構造が設計されています。

ワイヤー放電加工機は、ワイヤーとワークピースの間に、間欠的なパルス
電流を流しますので、比較的低い周波数から高い周波数に亘る広帯域の
ノイズ（電磁波）を発生すると考えられます。このような広帯域のノイズ
は、周波数が高くなるに従いレベルが低下しますから、2.45GHzの周波数
成分は僅かであって、電子レンジからの漏れと比べるまでもなさそうに
想像します。

一方、低周波成分の電磁波は、ワイヤを通して流れる電流に比例して発生
します。φ0.2程度のワイヤーに流せる実効電流は、高々数アンペアのオ
ーダーです。電気溶接の電流が100Aのオーダーにであるのに比べれば、
十分に小さい値です。従って、低周波成分の電磁波については全く心配
する必要がないと思います。

多少心配したほうがよいのは、上記の中間の周波数帯です。AMやFMのラジオ
が聞ける程度の状態であれば（多少ノイズが入るとしても）健康に対する
心配は全くないといっていいと思います。

怪しげな情報に振り回されて、疑心暗鬼になることの方が、健康に悪影響を
与える可能性が高そうに思います、

電磁（波）過敏症
http://www.jeic-emf.jp/EHS.html

恐らく、電磁波過敏症より↓の低周波／高周波騒音の被害の方が大きいと思う

低周波騒音
http://www.soumu.go.jp/kouchoi/knowledge/faq/main2.q14.f_qanda_16.html
https://www.jniosh.go.jp/publication/mail_mag/2015/86-column-1.html

高周波騒音
http://www.ince-j.or.jp/subcommittee/kosyuhaonkento
http://www.kobayasi-riken.or.jp/news/No82/82_2.htm

質問者さんの環境しだいでしょう。

電磁波計を購入して測定してみれば良い
http://www.ureruzo.com/denji_TM196.htm


まあ強迫観念に取り憑かれた人は
心配ないと言っても他人の言うこと信じないので
論より証拠で自分で測ってみるのが一番だと思う。

自分で測れと言われてグズグズ言ってるようなのは
単なる偏見で言ってるだけの迷惑モノだからすぐ判る。